Net zoals in elkegroenteteelt krijgen ook preitelers doorheen het seizoen af te rekenen met verschillende ziekten en plagen. De plantenkwekers staan in voor het aanleveren van gezond plantmateriaal, maar de eerste problemen voor de telers steken al enkele weken na het planten de kop op, vooral in droge, warme jaren. Dan is tabakstrips immers met voorsprong de belangrijkste plaag. Eenmaal de dagen korten en er meer dauw is, zien we ook bladziekten opkomen en dan kan roest het zwaarst toeslaan. Voor de winterprei komt hier ook nog eens papiervlekkenziekte bij.